150 Jahre, nachdem sich ein mysteriöser, schwarzer Nebel auf dem Planeten ausgebreitet und diesen zur Hälfte vernichtet hat, wird die Welt von einer 3000m hohen Mauer in zwei Teile geteilt. Die Hälfte der Menschheit lebt in Städten, die "Archen" genannt werden. Enishi Shido arbeitet als Detektiv in der 9. Arche. Als er einen Einbrecher vefolgt, kommt er einer massiven Verschwörung auf die Spur...